Российские федеральные силы проводили спецоперацию в селе Сержень-Юрт 18 мая 2001 года и задержали Шарани Асхарова, а также еще восемь человек. Шестеро затем были освобождены. Седьмой был найден мертвым. Шарани и еще один мужчина пропали без вести. Двое освобожденных мужчин подтвердили, что находились в БТР вместе с Шарани Асхаровым. Суд установил нарушение статей 2, 3, 5 и 13 Конвенции, а также статьи 38, которое выразилось в отказе российских властей предоставить Суду материалы уголовного дела.
9 ноября 2002 года несколько представителей российских вооруженных сил ворвались в дом в селе Урус-Мартан, где они провели несанкционированный обыск, проверку документов у всех членов семьи и задержали Вахида Мусиханова. Его увезли на бронированной машине, и до сих пор о нем ничего неизвестно. Уголовное дело о его исчезновении было приостановлено и возобновлено, но следствие не дало никаких существенных результатов.
Суд указал, что военной прокуратурой было установлено, что "6 марта 2002 года Муса Ахмадов был задержан группой военнослужащих на блокпосте у села Киров-Юрт, передан в штаб 51 полк воздушно-десантных войск, расположенный в Хатуни, и затем его перевели в особый отдел ФСБ, дислоцировавшийся в этом же лагере". Суд установил нарушение статей 2, 3, 5 и 13 Конвенции, а также статьи 38, которое выразилось в отказе российских властей предоставить Суду материалы уголовного дела.
Суд единогласно установил, что право на жизнь было нарушено в отношении Адама Ильясова. 15 ноября 2002 года представители российских федеральных войск незаконно обыскали дом Ильясовых в селе Мескер-Юрт. Они сломали мебель, двери и окна в доме, задержали Адама Ильясова и увезли его на одном из трех БТР. С тех пор Адам Ильясов «исчез». Уголовное дело по факту исчезновения не принесло никаких результатов.
Дело касается исчезновения Рамзана и Ризвана Хаджиалиевых. Братья были задержаны российскими военнослужащими в собственном доме в селе Самашки, Чечня, утром 15 декабря 2002 года. Через 4 дня их обезглавленные и изуродованные тела были найдены недалеко от города Серноводск, расположенного в 10 километрах от Самашки.
Дело касается исчезновения Ибрагима Исаевича Цурова, чеченского адвоката. Хотя внутригосударственным расследованием было установлено, что Ибрагима задержали 26 апреля 2003 года сотрудники Малгобекского отдела внутренних дел, но нет никаких известий об Ибрагиме со времени его ареста.
Дело с связано с исчезновениями Висхаджи Шатаевича Магомадова и Хасхана Шахтамировича Межиева, село Мескер-Юрт, Чечня. Двое мужчин пропали без вести после того, как 14 ноября 2002 года были задержаны в доме Висхаджи российскими военнослужащими и увезены на бронетранспортерах.
21 февраля 2001 года тела Саид-Рахмана Мусаева, Одеса Митаева и Магомеда Магомадова были найдены в заброшенном поселке «Здоровье» (также называемом «Дачное»), расположенном примерно в километре от Ханкалы. На телах были множественные огнестрельные и ножевые раны. Одесу отрезали одно ухо. Трупы других 48 человек были найдены позднее в близлежащем селе.
Дело связано с исчезновением Абдулкасима Заурбекова на территории временного отдела внутренних войск Октябрьского района г.Грозного 17 октября 2000 г. Абдулкасим зашел на территорию ВОВД в 11 часов утра. Его сын Айнди ждал его у входа до позднего вечера, но Абдулкасим не вернулся. В указанное время в октябрьский ВОВД Грозного проходили службу сотрудники милиции из Ханты-Мансийска, которые ранее уже были признаны как пренебрегающие правами человека.
Дело связано с исчезновением Бекхана Баргаева, Саид-Магомеда Дебизова и Изновра Сербиева. Российские военнослужащие во время проведения 14-16 января 2001 г. крупномасштабной спецоперации задержали десятки людей в соседних селах Новые Атаги и Старые Атаги. Все задержанные были затем освобождены, двое найдены мертвыми, а трое родственников заявителей исчезли.
В деле рассматривалось исчезновение Рамзана Расаева из собственного дома в селе Чечен-Аул, Чечня, 25 декабря 2001 года. Другие жители Чечен-Аула сообщили, что видели Рамзана в фильтрационном пункте для задержанных на окраине села. Российские власти подтвердили, что войска проводили спецоперацию в селе в момент задержания Рамзана, но отказались установить причастных к преступлению.
Дело касается исчезновения пятнадцатилетнего Ислама Домбаева и шестнадцатилетнего Мурата Льянова, которые вместе с третьим мальчиком были задержаны подразделением МВД России 28 июня 2000 года в Грозном, Чечня. Несмотря на то что следствие установило причастность силовых структур к исчезновению мальчиков, дело было приостановлено без каких-либо объяснений. В деле Суд установил также нарушение статьи 38 (1) (а), которое выразилось в отказе российских властей предоставить Суду материалы уголовного дела.
Первое дело об исчезновении в Ингушетии, рассмотренное Европейским Судом. Дело касается исчезновения отца и сына Халидовых в деревне Пседах Малгобекского района Ингушетии 29 ноября 2002 года. Иса и Шамиль Халидовы были задержаны сотрудниками силовых структур на сокозаводе, где они работали. Прокуратура Малгобекского района установила, что они были задержаны сотрудниками чеченского подразделения милиции, однако позже данное утверждение было опровергнуто прокуратурой Чечни. Расследование никаких видимых результатов не дало.
Европейский Суд по правам человека вынес свое 10 000-ое решение, в котором единогласно признал Россию виновной за насильственное исчезновение 20-летнего мужчины в Чечне в ноябре 2002 года. Суд серьезно раскритиковал неэффективное расследование обстоятельств исчезновения Аюба. Очевидно, что со стороны властей не было предпринято никаких серьезных усилий для установления местонахождения и судьбы Аюба Тахаева.
Дело касается задержания Магомеда и Харона Хумаидовых в их собственном доме в селе Махкеты (Чечня) 13 февраля 2002 года. Свидетели утвержают, что Магомед и Харон были увезены в расположение Федеральной службы безопасности в селе Хатуни. Хотя прокуратура установила, что к похищению причастны военнослужащие 45-го полка, следствие никого не привлекло к ответственности. Суд просил российские власти предоставить Суду материалы уголовного дела. Российские власти предоставили только небольшую часть документов, ссылаясь на секретность данных.
ЕСПЧ особенно критично оценил неэффективность расследования. Он считает, что в ходе расследования были установлены воинские подразделения и их командиры, участвовавшие в похищении, но против них не были выдвинуты обвинения, что должно расцениваться исключительно как халатность органов прокуратуры при проведении расследования и их нежелание вести расследование. Суд находит возмутительным тот факт, что после установления командира подразделения, причастного к задержанию Апти Исигова и Зелимхана Умханова расследование неоднократно приостанавливалось по причине невозможности установить виновных.
Жалоба касается исчезновения Рамзана Кукуева после его задержания 3 мая 2001 года российскими федеральными силами во время проведения массовой спецоперации в селении Ца-Ведено Чеченской Республики. Двое других мужчин после проведения этой спецоперации также пропали без вести. Хотя родственники немедленно сообщили властям о задержании, уголовные следствия в связи с этим были возбуждены только 25 ноября 2001 года.
Суд установил, что было нарушено право на жизнь в отношении исчезнувших братьев Апти и Мусы Эльмурзаевых в селе Мартан-Чу. 9 июля 2002 года российские военнослужащие задержали Апти Эльмурзаева в его собственном доме. 27 января 2003 года военные вновь вторглись в дом Эльмурзаевых и арестовали Мусу, который занимался поисками своего брата Апти. Нет никаких известий об Апти и Мусе с момента их похищения.
24 января 2003 года Муса и Магомед Гайтаевы были задержаны в своих домах в Урус-Мартане российскими военнослужащими. Во время задержания Магомед был опознан военным комендантом Урус-Мартана и позднее освобожден, хотя был избит. Но Муса с тех пор пропал без вести. Не смотря на попытки семьи установить его местонахождение, следствие о его исчезновении приостановлено.
Суд стал прибегать к ускоренному рассмотрению чаще, начиная с 2006 года, в некоторой степени для того чтобы справится с увеличивающимся количеством дел от российских граждан. Жалоба на исчезновение Ризвана Ибрагимова, после того как он был задержан российскими службами, была рассмотрена в ЕСПЧ по ускоренной процедуре.