"Правовая инициатива по России" в течение многих лет работает в сотрудничестве с другими правозащитными организациями и выражает им благодарность за постоянную поддержку.  В их числе: 

С 2008 года - после российско-грузинского конфликта, который произошел в августе этого года - "Правовая инициатива" сотрудничает с "Ассоциацией молодых юристов Грузии" (GYLA) и ведет вместе с этой организацией дела из Южной Осетии и Грузии.  

Дела о нарушениях прав человека в РФ ведут российские партнеры Фонда: организации "Правовое содействие - Астрея" и НОФ "Правовая инициатива".